Der Spross Ernst des Eisernen wurde am 18. Dezember 1418 in Wien geboren. Um 1436 wurde vertraglich beschlossen, dass er und sein Bruder, der spätere Kaiser Friedrich III., gemeinsam und gleichberechtigt das Habsburgerreich regieren sollen. Dabei würde Friedrich jedoch eine Vormachtsstellung innehaben. Albrecht war mit dieser Vereinbarung nicht zufrieden, setzte sich drüber hinweg und wurde zum Alleinherrscher der Vorlande.
Nachdem Ladislaus Postumus 1457 gestorben war, entbrannte der Zwist mit Friedrich um das Erbe erst recht. Nachdem er im selben Jahr die Universität von Freiburg gegründet hatte, setzte er sich gegen Friedrich soweit durch, dass ihm um 1458 Oberösterreich und dann um 1462 Niederösterreich zugesprochen wurde. Seine Ehe mit Mathilde von der Pfalz blieb kinderlos. Albrecht VI. starb am 2. Dezember 1463 in Wien, worauf Friedrich als nachfolgender Regent anerkannt wurde.